| アイテム | 入手場所 | 効果 |
| あかいウロコ | いかりのみずうみで赤いギャラドス撃破後 | ポケモンじいさんに渡すと
がくしゅうそうちをもらえる |
| アクセサリーいれ | コガネシティ地下 | アクセサリーを入れる |
| アンノーンノート | アルフの遺跡で石版パズルを解く | 捕まえたアンノーンを記録できる |
| いかりまんじゅう | チョウジタウンでおじさんから購入 | わざマシン64と交換できる |
| おとしもの | クチバシティ/ポケモンだいすきクラブ | リニアパスと交換できる |
| カードキー | 地下に閉じ込められたラジオ塔局長から入手 | ラジオ塔の奥に進める |
| きかいのぶひん | ハナダジム | 発電所が動くようになる |
| きのみプランター | ウソッキー撃破後 | きのみを4つまで育てられる |
| グラシデアのはな | コガネシティのフラワーショップへ
シェイミを連れて行く | シェイミをフォルムチェンジさせる |
| コインケース | コガネシティ地下で拾う | ゲームセンターのコインを入れる |
| じてんしゃ | コガネシティ/ミラクル・サイクル | 走るより速い速度で移動できる |
| シールいれ | 牧場でミルタンクの病気を治す
（オレンの実7個必要) | シールを入れる |
| ゼニガメじょうろ | コガネジム攻略後、隣のフラワーショップ | |
| ダウジングマシン | エンジュシティの民家 | マップに落ちている目に見えない
アイテムを探すことができる |
| ちかのかぎ | ラジオ塔でラムダから入手 | コガネシティ地下の奥に進める |
| ともだちてちょう | ポケモンセンターのB1F | フレンドコードを確認・登録ができる |
| バトルレコーダー | キキョウシティに入る際にコトネ（ヒビキ）にもらう | バトルビデオを記録できる |
| ひでんのくすり | タンバシティ薬屋で入手 | 灯台のデンリュウの病気を治す |
| ふしぎなタマゴ | ポケモンじいさんからもらう | ウツギ博士イベントアイテム |
| ふねのチケット | 殿堂入り後ウツギ博士からもらう | アサギシティ～クチバシティを移動
できる |
| ブルーカード | コガネラジオ塔2F、女の人から | ポイントカード |
| ぼんぐりケース | ヨシノシティの民家でもらう | ぼんぐりを保管できる |
| リニアパス | 発電所復旧後、クチバシティで入手した
ピッピ人形をモノマネむすめに返す | リニアモーターカーに乗れる |
| GBプレイヤー | ジムバッジ16個入手後、タマムシマンション
3F奥にいる人と話す | ラジオ番組等を聞ける |
| ボロのつりざお | 32番道路/ポケモンセンター | 水辺でポケモンを釣り上げられる |
| いいつりざお | アサギシティ/民家 | 水辺でポケモンを釣り上げられる |
| すごいつりざお | 12番道路/民家 | 水辺でポケモンを釣り上げられる |
| にじいろのはね | （金）ラジオ塔、攻略後局長から入手
（銀）ニビシティ/高台にいるおじいさんから入手 | スズのとうでホウオウと戦うのに
必要 |
| ぎんいろのはね | （銀）ラジオ塔、攻略後局長から入手
（金）ニビシティ/高台にいるおじいさんから入手 | うずまきじまでルギアと戦うのに
必要 |
| とうめいなスズ | ジョウト地方制覇後、エンジュシティで、
まいこはん五人抜きで入手（金限定） | スズのとうでホウオウと戦うのに
必要（金限定） |
| うみなりのスズ | ジョウト地方制覇後、エンジュシティで、
まいこはん五人抜きで入手（銀限定） | うずまきじまでルギアと戦うのに
必要（銀限定） |
| あいいろのたま | ポケモンじいさんから
入手（金限定） | うずもれのとうにカイオーガが出現
（金限定） |
| べにいろのたま | ポケモンじいさんから
入手（銀限定） | うずもれのとうにグラードンが出現
（銀限定） |
| もえぎいろのたま | うずもれの塔で捕獲できるグラードンと
カイオーガをオーキド博士に見せる | うずもれのとうにレックウザが出現 |
